A Sant Joan Despí hi ha 5 centres públics d'educació infantil i primària i 3 centres concertats, 2 centres públics d'educació secundària (instituts) i 2 centres privats-concertats, 1 centre d'educació especial, 4 escoles bressol públiques (3 municipals i 1 de la Generalitat) i 1 llar d'infants privada.
Centres Públics
· Llar d'infants La Pomera
· Escola Bressol Municipal El Gegant del Pi
· Escola Bressol Municipal Sol Solet
· Escola Bressol Municipal El Timbal
Centres Privats
· Llar d'infants l'Estel
· Ludoteca - El Bosc de les Fades
· Les Formiguetes- Espai de Criança i Lleure
Centres Públics
· CEIP Sant Francesc d'Assís
· CEIP Pau Casals
· CEIP Espai 3
· CEIP Joan Perich i Valls
· CEIP Roser Capdevila
Centres Concertats
· Escola Ateneu Instructiu
· Institució Educativa Gran Capità
· El Brot
Centres Públics
· IES Francesc Ferrer i Guàrdia
· IES Jaume Salvador Pedrol
Centres Concertats
· Ateneu Instructiu
· Institució Educativa Gran Capità
· El Brot
· Centre de Formació d’Adults Jujol
· Programa de Formació i Inserció (PFI)
· Centre de Formació Ocupacional i Contínua – Promoció Econòmica
· Cursos de Català per a Adults
· Escola d'Idiomes Moderns UB